日々の発見

勤務医の研究生活など　そのうち自分の役に立てば

jupyter notebook(ipython notebook)の開き方

ipython notebookは、jupyter notebookともいうようだ。

開くだけでも苦戦した。

端末画面で、

jupyter notebook

を実行すると、通常のユーザーとしてchromeを開いてください、みたいな表示が出る。

それを無視して、chromeで新しいタブを開き、

http://localhost:8888/tree#

を開くと、めでたくjupyter notebook画面が開く。

そこから、new→python3→目指す、notebook画面にたどりついた。

ggplot2をlinuxで使う場合(linux mint)

Ｒ Linux

linux mintは17.3に個人情報を流出させるウイルスを入れられた？とかで一時トラブルになっていたが、17.2は大丈夫そうなので引き続き使っている。

 

さて、ggplot2をlinuxで使いたいが、いざインストールしようとすると、

「最新のバージョンのRをインストールしてください」

的なエラーコメントが出て、インストールできない。

調べてみると、同様の症状に見舞われた人もいる様子。

 

linuxで普通にRをインストールしようとすると、現段階ではR3.0.xがインストールされてしまう（2016/04/17）が、ggplot2的には最新ではないのでNGらしい。

 

それで、linuxにR3.2.xとかをインストールしようと試みるが、出来ない。

"R-3.2.4.tar.gz"とかいうファイルをダウンロードしてきたものの、解凍することからつまづく。。

Canopyについて　＋　PATHを通すということ

python

 

python（IPython）でのデータ分析には必須のライブラリ群がある。それをまとめて入れられるパッケージがCanopy。

Canopy expressという無料のパッケージがあるのでサイトからダウンロードする。

何とかpythonに組み込んだが、pythonの画面からはパッケージが読み込めない。。

いろいろ探していると、Canopyというプログラムがインストールされている。

そこをクリックしてみると、Canopy editorというものがあって、Rstudio風に、パッケージも含めて使用できた。

 

パッケージが読み込めない、という問題について。

Linuxでは、パッケージのインストール後、PATHを通しておく、という操作が必要のよう。以下を参照した。

bio-info.biz

パスを追加したい〜.bashrc編〜 - ITmedia エンタープライズ

Pythonによるデータ分析入門

python

www.amazon.co.jp

  • IPhtyonを使ったデータ分析について解説した書籍
  • pythonのバージョンは2.7（python3ではない）
  • pythonの基本的な扱い方については全く説明がない
  • つまり、自分のような初心者には全く分からなかった

もうすこしpython自体を勉強してから戻ってこようと思う

 

レッツノート　BIOS起動　windows10 方法

windows

Windows8 搭載のレッツノートのBIOS起動の方法。

 
電源オプションから、高速スタートアップは解除
電源を切る
Deleteキー、またはF2を押しながら起動
例のBIOS画面が出る
 
インターネットで検索してもちゃんと出てこない。Windows8までの方法はちらほらあるが。
結局、説明書を参考にした。自分の場合はdeleteキーで上手く起動された。